Fujifilm heeft nieuwe firmware uitgebracht voor de X-E1. De firmware zelf is 36,5MB groot en moet naar een geformatteerde geheugenkaart worden gekopieerd. Vervolgens moet de camera aangezet worden terwijl de back-knop ingedrukt wordt. Uitgebreidere instructies kunnen op deze pagina worden gevonden. In versie 1.01 zijn de volgende veranderingen en verbeteringen aangebracht:
